根據(jù)滬文管發(fā)[2008]349號文，上海水產(chǎn)大學鯨館經(jīng)上海市文物管理委員會同意，正式更名為上海海洋大學博物館。在校領導的關心、支持下，上海水產(chǎn)大學鯨館自成立以來，已累計接待十萬余名海內外參觀者，社會影響日益擴大，有效發(fā)揮了上海水生生物科普教育基地的功能，為發(fā)展上海科普事業(yè)，傳承民族文化，塑造學校形象作出了貢獻。2005年水產(chǎn)大學鯨館被上海市科教黨委批準列為上海高校民族文化博物館之一。

    因5月6日上海水產(chǎn)大學正式更名為上海海洋大學，“上海水產(chǎn)大學鯨館”名稱已不適用。同時，為便于內涵發(fā)展需要，經(jīng)主管校領導同意，報請上海市文物管理委員會批準，上海水產(chǎn)大學鯨館更名為上海海洋大學博物館，下設鯨館、上海水生生物科技館等。